Engineering cellular communication between light-activated synthetic cells and bacteria
设计光激活合成细胞和细菌之间的细胞通讯
基因表达组件总是由简单、模块化的部件组装而成,是可用于创建具有生命功能的最小合成细胞的多功能平台。通过将基因调控序列结合在DNA模板中,可以根据特定的刺激控制原位基因表达,从而控制合成细胞功能。在这篇文章中,通过在光激活的DNA模板上编码感兴趣的基因,达到使用光来控制合成细胞内的无细胞蛋白质合成的目的。
Part 01、设计目标
图1. 系统机制示意图
T7启动子区域内含有可被紫外线裂解的阻遏分子,该阻遏分子严格抑制转录,直到用紫外线去除阻断基团。通过这种方式,合成细胞以光控制的方式被远程激活。以此激活酰基高丝氨酸内酯合酶BjaI的表达,用光控制合成细胞和细菌之间基于群体感应的通信。
Part 02、光控开关
Light-activated gene expression in synthetic cells.
图2.光裂解T7启动子阻遏因子的基因线路示意图
通过光裂解结合在T7 启动子上的生物素、单价链霉亲和素和可裂解linker控制RNA聚合酶与T7启动子结合,转录翻译报告基因mNeonGreen。
图3. b. 有或无紫外线照射下合成细胞内光激活mNG表达的荧光显微镜图像 c. 基于圆检测的图像分析脚本定量mNG表达
图3显示,未用紫外光照射的合成细胞表达的mNG最小,其GFP通道荧光强度与含有PURExpress但没有DNA模板的合成细胞一致。受到紫外光照射的合成细胞可以表达mNG。
Part 03、光调控的空间控制
Spatially controlled activation of light-activated synthetic cells.
图4.Photomask硬件示意图
将含有LA-mNG DNA的合成细胞固定在1.5%琼脂糖内,并用不透光的图案控制紫外光照射区域。黑暗区域阻止了紫外线的通过,下面的囊泡不表达mNG。白色区域允许光通过,解开LA-DNA抑制并刺激基因表达。
图5.实验结果图,由图可以看出合成细胞仅在暴露于紫外线的区域表达mNG。
Part 04、群体感应通讯
Quorum sensing through BjaI/BjaR System
图6.BjaR/PjaI系统示意图
BjaR启动子对Ⅳ-HSL高度敏感:
Off site:在BjaI基因不表达时,不产生Ⅳ-HSL,BjaR启动子与RNA聚合酶的结合被阻断,下游基因不表达。
On site:在BjaI基因表达时,产生HSL合酶,代谢产生Ⅳ-HSL,结合到BjaR启动子相应位点,使之与RNA聚合酶结合,启动下游基因表达。
图7.体内合成Ⅳ-HSL示意图
Part 05、光调控的群体感应通讯实现
Light-activated communication between synthetic cells and living cells.
图8.最终实现示例图